在農業生態係統中生物的種類繁多 ，主要有土壤生物 、森林生物 、淡水生物 、草原與草山生物 、農田生物 。總結一下 ，土壤生物的作用主要有以下幾個方麵 ：
一 、土壤生物促進土壤形成 。母岩風化的礦化物質並不是土壤 ，還要加入有機物質和能量並經過生物的作用才能形成土壤 。土壤生物對土壤的形成起著關鍵作用 。
二 、土壤生物改善土壤的物理性能 。種植於土壤中的深根植物 、挖掘土壤的動物和數量巨大的微生物的活動 ，大大改善了土壤的結構 、孔隙度和通氣性 。脊椎動物尤其是齧齒類動物挖掘深度1~2m ，有的旱獺洞可深達4m;有的地方每公頃可達20萬個洞 。打洞疏鬆了土壤 ，加速了土壤的風化作用 ，改善了土壤的水熱狀況 。
三 、土壤生物提高了土壤質量 。據分析 ，經過蚯蚓作用的土壤在有效磷 、有效鉀 、有效鈣等多方麵都有明顯增加 。
四 、土壤生物影響土壤覆蓋層 。有些動物從土層中掘出大量土壤堆積成土丘 ，改變了局部地形 。在風力的作用下 ，疏鬆的土壤被吹走 。這樣在有洞穴的地方形成了盆地 。在雨水的作用下 ，又出現了灌木 、鹽木及草本植物 。
